Le coronavirus équin (ECoV) est une maladie très contagieuse transmise entre chevaux qui peut provoquer de la fièvre, de l’anorexie, de la diarrhée et des coliques. [1][2][3]

La plupart des chevaux guérissent du coronavirus équin grâce à des soins de soutien. Dans les cas graves, les chevaux atteints peuvent nécessiter des traitements spécifiques tels que l’administration d’électrolytes, de liquides, d’anti-inflammatoires et d’antibiotiques.

La mort due à la maladie est rare et on pense qu’elle est secondaire aux complications associées à la perturbation de la barrière gastro-intestinale. [1]

Il n’existe pas de vaccin contre le coronavirus équin. Des pratiques de biosécurité adéquates dans votre écurie peuvent réduire considérablement le risque que les chevaux contractent la maladie. [1]

Les stratégies de prévention de la transmission du coronavirus chez les chevaux comprennent la mise en quarantaine des chevaux malades, la pratique d’une bonne hygiène dans les installations équines et la surveillance des chevaux pour déceler les signes de maladie. [1]

Qu’est-ce que le coronavirus équin ?

Le coronavirus équin est un membre de la famille des Coronaviridae qui infecte les amphibiens, les oiseaux et les mammifères. Cette famille de virus est responsable de maladies des systèmes gastro-intestinal, respiratoire, hépatique et neurologique. [1]

Les virus de la famille des Coronaviridae sont appelés virus à ARN car leur matériel génétique est constitué d’acide ribonucléique (ARN). [1]

La famille des Coronaviridae comprend les coronavirus alpha, bêta, gamma et delta. Le coronavirus équin est un coronavirus bêta.

D’un point de vue génétique, le coronavirus équin et le coronavirus bovin sont apparentés. Les coronavirus équins et bovins ne sont pas infectieux pour l’homme. [1]

Le coronavirus équin peut affecter les chevaux de tous âges et de toutes races. Le virus se transmet par voie oro-fécale (ingestion orale de matières fécales) contaminées par le virus. [1]

Le diagnostic de l’ECoV repose sur les symptômes cliniques et les tests de laboratoire. Le test qPCR est utilisé pour établir un diagnostic définitif de la maladie. [1]

Les signes cliniques de l’ECoV apparaissent généralement deux à trois jours après l’exposition au virus. Tous les chevaux atteints du coronavirus équin ne présentent pas de signes cliniques ; certains sont des porteurs asymptomatiques du virus. [1]

Prévalence

Des foyers de coronavirus équin ont été signalés chez des chevaux aux États-Unis, en Europe et au Japon. [1][4][5][6][7] Les cas sont connus pour se produire sporadiquement et dans le cadre de foyers. [1]

Les foyers ont été signalés plus fréquemment chez les chevaux utilisés pour l’équitation, les courses et les concours que chez les chevaux utilisés pour l’élevage. [1]

Selon trois laboratoires de diagnostic vétérinaire américains, les cas de maladie ont augmenté depuis 2010, date à laquelle le test quantitatif de réaction en chaîne de la polymérase (qPCR) a été introduit dans les laboratoires de diagnostic moléculaire. [1]

Comment le coronavirus équin se transmet-il ?

On pense que le coronavirus équin se transmet par les excréments des chevaux infectés. Les chevaux sont infectés par le virus lorsqu’ils ingèrent des matières fécales contaminées par le virus. [1]

Lors d’expériences de recherche en laboratoire, l’ECoV a également été transmis par voie naso-œsophagienne. [1]

Période d’incubation

Une fois que le virus a pénétré dans l’organisme, la période d’incubation est courte. Les signes cliniques de l’affection se développent entre 48 et 72 heures après l’exposition naturelle au virus ou l’infection induite par l’expérience. [1]

Excrétion virale

Les chevaux infectés commencent à excréter le virus dans leurs excréments trois à quatre jours après l’exposition. Le pic d’excrétion se produit généralement trois à quatre jours après l’apparition des signes cliniques. [1]

Les chevaux qui ont contracté naturellement le virus peuvent l’excréter dans leurs excréments pendant 25 jours. Ceux dont l’infection a été induite expérimentalement peuvent excréter le virus dans leurs excréments pendant 10 à 12 jours. [8]

On ne sait pas combien de temps le coronavirus équin peut rester dans l’environnement et provoquer une infection. [1]

Bien que l’ECoV puisse être présent tout au long de l’année, la maladie est le plus souvent signalée au cours des mois les plus frais, d’octobre à avril.

Les chercheurs pensent que le virus peut se répliquer plus rapidement à des températures plus froides, ce qui entraîne une augmentation du nombre de cas durant les mois les plus froids de l’année. [1]

L’excrétion se produisant deux à trois jours après l’apparition des signes cliniques, certains chevaux peuvent présenter un résultat négatif au test de dépistage du virus pendant les tout premiers stades de la maladie clinique. [1]

Effets du coronavirus équin

Le coronavirus équin se présente généralement sous la forme d’une infection unique (mono-infection) chez les chevaux adultes âgés de plus de deux ans. [9] Les poulains atteints du coronavirus équin et présentant des signes cliniques du virus sont plus susceptibles d’être co-infectés que les chevaux adultes.

Une étude a montré que toutes les infections par le virus ECoV chez les poulains présentant une maladie gastro-intestinale étaient associées à des co-infections, alors que la plupart des poulains sains infectés par le virus n’avaient pas d’autres types d’infections. [1][10]

Une étude menée sur des poulains dans le centre du Kentucky a révélé que l’excrétion du coronavirus équin se produisait chez des sujets sains et chez des sujets souffrant de maladies gastro-intestinales. Cette étude suggère que le virus peut circuler parmi les poulains qui ne présentent pas de signes cliniques de la maladie. [10]

Signes et symptômes

Entre 10 et 80 % des chevaux infectés par le coronavirus équin présentent des signes de la maladie. [1]

Certains chevaux infectés ne présentent aucun signe clinique du virus (ils sont asymptomatiques). Ils sont néanmoins porteurs du virus et peuvent le transmettre à d’autres chevaux par l’intermédiaire de leurs excréments. [11]

Les signes du coronavirus chez les chevaux durent généralement de quelques jours à une semaine. [1] Les signes cliniques courants sont les suivants :

  • Anorexie
  • Dépression
  • Fièvre
  • Diarrhée
  • Coliques
  • Sécrétions nasales

Les résultats de laboratoire associés à l’ECoV sont les suivants : [1]

  • Anomalies de nombre des globules blancs
  • Changements dans les concentrations d’électrolytes en cas de maladie intestinale
  • Taux de bilirubine élevé en raison de la perte de poids entraînant une anorexie.

Selon les données recueillies lors de 16 foyers survenus entre 2011 et 2014, 30 % des 406 chevaux présentaient des signes cliniques de l’ECoV : [1]

  • Les signes les plus courants de la maladie étaient la perte de poids (98 %), la léthargie (89 %) et la fièvre (84 %).
  • Les chevaux atteints de fièvre due à l’ECoV avaient des températures rectales allant de 38,6 à 41°C ou de 101,4 à 105,8°F.
  • 18 % des chevaux atteints présentaient des changements dans la consistance de leurs fèces.

Le pourcentage de chevaux asymptomatiques au cours d’une épidémie d’ECoV a été observé entre 11 et 83 %. [12]

Complications

Dans de rares cas de coronavirus équin, le fonctionnement normal du cerveau peut être altéré (encéphalopathie) en raison de niveaux élevés d’ammoniaque (hyperammoniémie) dans le sang.

L’encéphalopathie peut être une complication du coronavirus chez les chevaux en raison d’une augmentation de la production d’ammoniac due à une prolifération bactérienne dans les intestins ou à une absorption accrue d’ammoniac par une barrière muqueuse intestinale endommagée. [1][13]

Les chevaux atteints de cette complication peuvent présenter les symptômes suivants :

  • Tournoiement
  • Poser la tête contre des objets
  • Mauvaise coordination musculaire
  • Mouvements involontaires des yeux
  • S’allonger plus fréquemment
  • Crise d’épilepsie

Diagnostic

Contactez votre vétérinaire dès que possible si vous remarquez que votre cheval ne se comporte pas ou ne se sent pas normalement. Le diagnostic de cette maladie repose sur les signes cliniques et les tests de laboratoire.

Un vétérinaire peut déterminer si votre cheval est atteint du coronavirus équin et exclure d’autres affections susceptibles de provoquer des signes intestinaux et respiratoires. Par exemple, diverses maladies respiratoires provoquent des sécrétions nasales qui ne sont pas associées à l’ECoV.

La prévalence du coronavirus équin dans les sécrétions nasales des chevaux atteints de fièvre et de maladies respiratoires est faible. [14] Une étude portant sur 2 437 chevaux présentant de la fièvre et des signes de maladie respiratoire a révélé que l’ECoV était détecté dans moins de 1 % des échantillons de sécrétions nasales. [14]

Les chevaux qui présentent des signes cliniques, notamment une fièvre soudaine, une léthargie et une anorexie, mais qui ne présentent pas de signes respiratoires, doivent subir un test de dépistage de l’ECoV dans leurs excréments. [1]

Échantillons fécaux pour le test PCR

Le coronavirus équin peut être détecté dans des échantillons fécaux de chevaux infectés à l’aide du test quantitatif de réaction en chaîne de la polymérase (qPCR).

D’après les recherches menées sur des populations de chevaux ayant connu des épidémies de virus, le taux de précision du test qPCR est supérieur ou égal à 90 %. [1][12]

L’échantillon fécal utilisé pour le test doit être prélevé à l’état frais et conservé dans un récipient ou un sac étanche. [16] Les échantillons doivent être conservés au froid ou congelés afin d’éviter une croissance bactérienne excessive susceptible d’interférer avec le test PCR.

Pronostic

Le pronostic pour les chevaux diagnostiqués avec le coronavirus équin est bon et la plupart d’entre eux se rétablissent complètement et sans complications. [1] Les signes cliniques de l’ECoV disparaissent généralement avec un minimum de soins de soutien.

La quantité d’ECoV dans la circulation sanguine (charge virale) des chevaux infectés influe sur les résultats cliniques et les taux de mortalité. [1][15] Elle dépend de la souche spécifique du coronavirus responsable de l’infection que le cheval a contractée.

Le coronavirus équin a un faible taux de mortalité. Si le décès est dû à l’ECoV, il est généralement associé à une maladie secondaire : [1]

  • Une inflammation systémique causée par une diminution de la fonction de la barrière intestinale (endotoxémie)
  • Un endommagement par l’organisme de ses propres tissus et organes en réponse à l’infection (septicémie)
  • Des lésions cérébrales (encéphalopathie).

Une petite étude portant sur 14 chevaux miniatures a révélé que cette race présentait un taux de mortalité accru dû au coronavius équin par rapport aux taux de létalité précédemment signalés dans les épidémies touchant d’autres races. [16]

Traitement

Il n’existe actuellement aucun traitement antiviral ni aucun vaccin contre le coronavirus équin. [1]

La plupart des chevaux adultes présentant des signes cliniques d’infection par l’ECoV se rétablissent sans traitement spécifique sur une période de quelques jours ou plus. [1]

Les chevaux présentant des signes cliniques persistants peuvent avoir besoin de médicaments administrés par voie orale, intraveineuse ou par intubation nasogastrique. Les cas les plus graves peuvent nécessiter un traitement approfondi ou une hospitalisation.

Les traitements potentiels du coronavirus chez les chevaux sont les suivants : [1]

Médicaments anti-inflammatoires

Les chevaux infectés par le virus ECoV et présentant une température rectale constamment élevée, une anorexie et une dépression peuvent être traités avec des anti-inflammatoires non stéroïdiens tels que la Banamine (flunixine méglumine) ou le Bute (phénylbutazone).

Liquides et électrolytes

Les chevaux souffrant de coliques, d’anorexie et/ou de diarrhée peuvent avoir besoin d’une administration orale ou intraveineuse de liquides et d’électrolytes jusqu’à ce que leur niveau d’hydratation et d’électrolytes se normalise et que leurs signes cliniques disparaissent.

Antimicrobiens

Les médicaments antimicrobiens peuvent être utilisés pour traiter les chevaux qui développent des signes d’infection systémique avancée en raison de la rupture de leur barrière gastro-intestinale.

Agents protecteurs gastro-intestinaux

Les probiotiques et autres agents gastro-protecteurs peuvent être bénéfiques pour aider à réparer une barrière gastro-intestinale endommagée chez les chevaux atteints.

Transfaunation fécale

Les chevaux atteints de coronavirus équin et d’hyperammoniémie peuvent être traités par transfusion fécale (transfert de bactéries du tractus intestinal d’un sujet sain à un autre sujet) afin de restaurer leur flore intestinale.

Les chevaux atteints d’hyperammoniémie peuvent également nécessiter des traitements supplémentaires, notamment des antibiotiques et des agents laxatifs tels que le lactulose.

La prévention

La meilleure méthode de prévention du coronavirus équin consiste à maintenir les installations de votre cheval aussi propres que possible.

Les pratiques de gestion visant à réduire la transmission de cette maladie dans les installations équines sont les suivantes : [1]

Mise en quarantaine des chevaux malades

Le coronavirus équin étant très contagieux, tout cheval qui présente des signes cliniques de maladie doit être isolé jusqu’à ce que le diagnostic soit confirmé.

Les signes à surveiller sont la fièvre, la perte d’appétit et la dépression, avec ou sans signes supplémentaires de coliques ou de diarrhée.

Tests post-infection

Les chevaux qui se remettent de l’ECoV doivent être testés pour déterminer quand ils n’excrètent plus le virus dans leurs excréments.

Jusqu’à ce qu’ils cessent d’excréter le virus, ils doivent être tenus à l’écart des autres chevaux afin d’éviter la propagation du virus.

Évaluation des signes cliniques

Les chevaux que l’on soupçonne d’avoir été exposés au coronavirus équin doivent être contrôlés deux fois par jour pour détecter les signes cliniques de la maladie. Prendre la température rectale pour déterminer s’il s’agit d’une infection virale.

Utilisation des pédiluves

Les pédiluves doivent être utilisés pour désinfecter les chaussures avant de passer d’une zone où un cheval infecté est hébergé à d’autres zones d’une installation équine.

Pratiquer une bonne hygiène

Les personnes qui s’occupent des chevaux et les cavaliers doivent désinfecter soigneusement leurs bottes, leur harnachement et leurs mains après tout contact avec des chevaux infectés par le coronavirus équin.

Les chevaux infectés doivent être manipulés en dernier lors de l’alimentation, du pansage et du nettoyage des stalles, afin d’éviter la transmission de l’infection à d’autres chevaux.

Désinfection des remorques et des stalles

Tous les véhicules utilisés pour le transport des chevaux doivent être soigneusement nettoyés et désinfectés après usage. Les stalles qui hébergent des chevaux malades doivent être désinfectées avant qu’un autre cheval ne les utilise.

Le coronavirus équin est détruit par les désinfectants courants, notamment l’hypochlorite de sodium, la povidone iodée, le gluconate de chlorhexidine, les phénols, les composés d’ammonium quaternaire, le peroxyde d’hydrogène et les composés peroxygénés.

Manipulation soigneuse du fumier

Le fumier des chevaux infectés étant contaminé, il doit être éliminé avec précaution. Tout outil ou équipement entrant en contact avec le fumier contaminé doit être désinfecté afin d’éviter la propagation du virus.

Le fumier doit être éliminé de manière à ne pas contaminer les pâturages, les enclos ou l’eau de boisson.

Utilisation d’équipements séparés

Les outils de pansage, la sellerie, la litière et les mangeoires utilisés pour les chevaux atteints du coronavirus équin ne doivent pas être utilisés pour d’autres chevaux, sauf si l’équipement a été soigneusement nettoyé et désinfecté.

Consultez votre vétérinaire et appliquez soigneusement les stratégies ci-dessus si vous pensez qu’un ou plusieurs de vos chevaux sont porteurs du coronavirus équin. Avec des soins et une gestion appropriés, la plupart des chevaux se rétablissent complètement et sans complications.

Si votre cheval a perdu beaucoup de poids au cours de la maladie, consultez un nutritionniste équin afin de formuler un plan d’alimentation pour le remettre sur la bonne voie.

Manque-t-il quelque chose dans l’alimentation de votre cheval?

Identifier les manques dans le programme alimentaire de votre cheval pour optimiser son bien-être.

Analyser maintenant

Références

  1. Pusterla, N. et al. Equine coronavirus: An emerging enteric virus of adult horses. Equine Vet Educ. 2016.
  2. Schaefer, E et al. Investigation of an experimental infection model of equine coronavirus in adult horses. J Vet Intern Med. 2018.
  3. Mattei, DN. et al. Equine Coronavirus-Associated Colitis in Horses: A Retrospective Study. J Equine Vet Sci. 2020.
  4. Miszczak, F. et al. First detection of equine coronavirus (ECoV) in Europe. Vet. Microbiol. 2014.
  5. Nemoto, M. et al. Experimental inoculation of equine coronavirus into Japanese draft horses. Virol. 2014.
  6. Oue, Y. et al. Isolation of an equine coronavirus from adult horses with pyrogenic and enteric disease and its antigenic and genomic characterization in comparison with the NC99 strain. Microbiol. 2011.
  7. Oue, Y. et al. Epidemic of equine coronavirus at Obihiro Racecourse, Hokkaido, Japan in 2012. J Vet Med Sci. 2013.
  8. Pusterla N, Vin R, Leutenegger CM, Mittel LD, Divers TJ. Enteric coronavirus infection in adult horses. Vet J. 2018.
  9. Equine enteric coronavirus. Cornell University College of Veterinary Medicine. 2016.
  10. Slovis, N.M. et al. Infectious agents associated with diarrhoea in neonatal foals in central Kentucky: a comprehensive molecular study. Equine Vet. J. 2014.
  11. Kambayashi, Y. et al. Outbreak of equine coronavirus infection among riding horses in Tokyo, Japan. Comp Immunol Microbiol Infect Dis. 2021.
  12. Pusterla, N. et al. Emerging outbreaks associated with equine coronavirus in adult horses. Microbiol. 2013.
  13. Giannitti, F. et al. Necrotizing enteritis and hyperammonemic encephalopathy associated with equine coronavirus infection in equids. Pathol. 2015.
  14. Pusterla, N et al. Prevalence of equine coronavirus in nasal secretions from horses with fever and upper respiratory tract infection. Veterinary Record. 2015.
  15. Chen, W. et al. Nasopharyngeal shedding of severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus is associated with genetic polymorphisms. Clin Infect Dis. 2008.
  16. Fielding, C.L. et al. Disease associated with equine coronavirus infection and high case fatality rate. J Vet Intern Med. 2015.