Diagnostic des infections fongiques chez les chevaux : guide du vétérinaire sur les tests de laboratoire spécialisés

Les maladies fongiques chez les chevaux comprennent une gamme d’affections pouvant toucher la peau, les voies respiratoires, les yeux et les organes internes. Bien que moins fréquentes que les infections bactériennes ou virales, les infections fongiques sont souvent plus insidieuses et difficiles à diagnostiquer.

Comme les signes cliniques peuvent être subtils ou imiter d’autres maladies, le diagnostic précis des infections fongiques repose sur une évaluation clinique appuyée par des tests diagnostiques. Le diagnostic combine généralement un examen microscopique, une culture et des analyses moléculaires.

L’examen microscopique direct des tissus affectés peut révéler des éléments fongiques confirmant l’infection, tandis que la culture fongique permet l’identification de l’espèce et les tests de sensibilité aux antifongiques. Les techniques moléculaires, y compris la réaction en chaîne par polymérase (PCR), offrent une confirmation rapide et sensible, en particulier pour les organismes à croissance lente ou difficiles à cultiver.

L’identification rapide et précise des agents pathogènes fongiques est essentielle pour orienter le traitement et améliorer les résultats. Comme la thérapie antifongique peut être coûteuse et prolongée, confirmer le diagnostic avant le traitement assure à la fois l’efficacité et une utilisation responsable des antimicrobiens.

Poursuivez votre lecture pour en apprendre davantage sur le processus de diagnostic des infections fongiques chez les chevaux, les raisons pour lesquelles votre vétérinaire pourrait recommander des tests spécialisés, et comment interpréter les résultats des tests fongiques.

Diagnostic des infections fongiques chez les chevaux

Les champignons sont des organismes complexes présents dans l’environnement sous forme de levures, de champignons ou de moisissures. ^[1] Ils constituent une classe d’organismes résistants en raison de leur paroi cellulaire robuste, ce qui peut rendre le traitement des infections fongiques difficile.

Ils se reproduisent par bourgeonnement (division en deux organismes) ou en produisant des hyphes fongiques, de longues structures filamenteuses (semblables à des fils) capables d’envahir profondément les tissus. ^[1] Ces hyphes produisent des structures reproductrices ou des spores fongiques qui propagent le champignon vers de nouveaux sites.

Les chevaux sont constamment exposés aux champignons présents dans leur foin, leur litière, les pâturages et les paddocks. Malgré cela, les maladies fongiques sont considérées comme rares chez les chevaux. ^[2]

La plupart des agents pathogènes fongiques sont des envahisseurs opportunistes, ce qui signifie qu’ils n’affectent que les chevaux atteints d’une maladie sous-jacente ou ceux qui sont immunodéprimés ^[1]. Les situations courantes qui peuvent être plus susceptibles de développer une infection fongique comprennent :

• Plaies cutanées
• Abrasions ou ulcérations cornéennes
• Anomalies anatomiques vulvaires chez les juments reproductrices, entraînant une infection utérine
• Immunodépression secondaire à la maladie de Cushing (PPID)

Infections fongiques courantes

Les infections fongiques équines courantes comprennent : ^[3]

• Infections à levures, telles que les espèces Candida ou Malassezia
• Dermatophytose (teigne, également connue sous le nom de démangeaison de sangle)
• Pythiose
• Phaeohyphomycose
• Sporotrichose
• Aspergillose

Les champignons véritablement infectieux provoquent généralement des infections systémiques (de tout le corps) qui sont difficiles à traiter et peuvent être mortelles. Heureusement, les infections fongiques systémiques sont rares chez les chevaux.

Un diagnostic rapide est essentiel pour traiter ces affections et améliorer le pronostic.

Les infections fongiques équines potentiellement mortelles comprennent : ^[3]

• Histoplasmose
• Cryptococcose
• Coccidioïdomycose
• Blastomycose

Signes cliniques

Les signes cliniques des infections fongiques opportunistes chez les chevaux dépendent de l’emplacement de l’infection.

Dans certains cas, aucun signe clinique n’est visible.

Les signes possibles des infections fongiques opportunistes comprennent :

• Signes d’ulcères cornéens : Larmoiement, plissement des yeux, opacité cornéenne, écoulement mucopurulent, défauts cornéens visibles ou sensibilité excessive à la lumière
• Signes de plaies cutanées ou d’infection : Croûtes, perte de poils, lésions ulcérées ou qui ne cicatrisent pas, enflure, chaleur, écoulement ou douleur localisée
• Signes d’endométrite ou de placentite : Écoulement vulvaire, développement prématuré de la mamelle, inconfort abdominal, gestation écourtée ou changements dans l’activité fœtale
• Signes de maladie des poches gutturales : Écoulement nasal unilatéral, difficulté à avaler, toux, saignements de nez, hochement de tête ou bruits respiratoires anormaux

Les signes cliniques des infections fongiques systémiques chez les chevaux comprennent : ^[3]

• Fièvre
• Toux
• Bruits pulmonaires anormaux ou difficulté à respirer
• Écoulement nasal
• Perte d’appétit
• Perte de poids
• Ganglions lymphatiques enflés
• Signes neurologiques, tels que des convulsions ou des mouvements non coordonnés

Une infection fongique est également responsable de la mycose des poches gutturales, une affection où des champignons Aspergillus envahissent les grosses artères qui traversent les poches gutturales. Si les champignons endommagent de façon importante les parois artérielles, ils peuvent provoquer des saignements de nez graves pouvant entraîner la mort. ^[1]

Prélèvement d’échantillons

Si un vétérinaire soupçonne une infection fongique, il prélèvera des échantillons diagnostiques à partir de la zone affectée afin de vérifier la présence d’organismes fongiques. Le type d’échantillon prélevé dépend de l’emplacement et de la nature de l’infection.

Les échantillons courants pour diagnostiquer une maladie fongique chez les chevaux sont : ^[1]

• Échantillon de tissu, comme une biopsie ou un raclage cornéen
• Échantillons de poils
• Sang
• Échantillons de liquide, comme utérin ou liquide respiratoire
• Écouvillons respiratoires

Lors du prélèvement des échantillons, le vétérinaire veille à éviter toute contamination de l’échantillon. L’introduction de spores fongiques provenant de l’environnement dans l’échantillon soumis peut entraîner un faux positif, soit l’identification d’un champignon alors qu’aucune infection fongique n’est présente.

Pour cette raison, les vétérinaires utilisent des techniques aseptiques, comme le nettoyage de la zone entourant le site de prélèvement et l’utilisation d’équipement stérile lors du prélèvement d’échantillons pour les analyses fongiques. ^[1]

Une manipulation appropriée de l’échantillon est nécessaire pour prévenir la prolifération bactérienne, qui pourrait éliminer tout champignon présent dans l’échantillon. La plupart des échantillons sont transférés dans un milieu de culture fongique peu de temps après le prélèvement ou envoyés immédiatement au laboratoire de diagnostic. Cela garantit que tout organisme fongique présent dans l’échantillon est préservé. ^[1]

Tests diagnostiques

Il existe plusieurs méthodes pour diagnostiquer les infections fongiques à partir d’un échantillon équin. Les méthodes les plus courantes sont : ^[1]

• Examen microscopique
• Culture fongique
• Réaction en chaîne par polymérase
• Test antigénique
• Sérologie

Certains laboratoires peuvent également offrir des tests de sensibilité aux antifongiques, ce qui permet aux vétérinaires de sélectionner l’antifongique le plus efficace pour traiter le champignon identifié. ^[1]

Examen microscopique

Les diagnosticiens peuvent identifier des organismes fongiques au microscope, ce qui leur permet de les caractériser selon leur forme et d’autres caractéristiques. Cela peut aider à réduire la liste des espèces potentielles responsables de l’infection, permettant au vétérinaire de choisir des traitements antifongiques appropriés. ^[1]

Les échantillons appropriés pour un examen microscopique comprennent : ^[1]

• Frottis d’empreinte
• Aspirats
• Biopsies tissulaires
• Sédiments de fluides

Les deux principales formes d’organismes fongiques visibles au microscope sont les levures et les hyphes. ^[1]

Les levures apparaissent sous forme de structures circulaires ou en bourgeonnement. Les espèces de Candida sont des exemples classiques de champignons formant des levures. Les moisissures, telles que Aspergillus, produisent des hyphes qui forment de longs filaments s’étendant à travers l’échantillon.

La taille des hyphes, l’angle de ramification et leur apparence peuvent aider les diagnosticiens à préciser l’espèce. Les levures et les hyphes peuvent être mises en évidence à l’aide de colorations spéciales qui se lient aux parois cellulaires fongiques et améliorent leur visibilité. ^[1]

En plus de confirmer la présence d’éléments fongiques, l’examen microscopique des échantillons de biopsie permet d’évaluer la réaction des tissus environnants.

La présence d’inflammation ou de mort tissulaire peut appuyer le diagnostic d’une véritable infection plutôt que d’une contamination. Cela peut également déterminer l’étendue des dommages tissulaires, ce qui peut aider les vétérinaires à établir un pronostic.

Culture fongique

Le laboratoire de diagnostic peut faire croître le champignon sur des milieux de culture spéciaux afin d’aider à identifier l’espèce. Certains champignons se développent mieux sur des milieux de culture particuliers, ce qui permet aux diagnosticiens de restreindre les espèces potentielles. ^[1]

En fonction du type de croissance fongique, des changements de couleur et d’autres caractéristiques, le laboratoire peut établir un diagnostic final. ^[1] Ils peuvent également prélever des échantillons des organismes fongiques cultivés pour une analyse au microscope ou à l’aide de la réaction en chaîne par polymérase. ^[1]

Bien que la culture fongique soit considérée comme le gold standard pour le diagnostic, elle présente plusieurs limites. De nombreux champignons se développent lentement, nécessitant parfois plusieurs jours à plusieurs semaines avant que les colonies ne soient visibles, ce qui peut retarder les décisions de traitement.

Certains champignons peuvent ne pas se développer en culture, entraînant des résultats faussement négatifs. La contamination par des spores environnementales constitue un autre défi, en particulier si les échantillons ne sont pas prélevés ou manipulés de manière aseptique. Pour ces raisons, les résultats de culture doivent toujours être interprétés conjointement avec l’examen microscopique et les constatations cliniques.

Réaction en chaîne par polymérase

La réaction en chaîne par polymérase (PCR) est une technique de laboratoire utilisée pour multiplier rapidement des séquences d’ADN spécifiques présentes dans un échantillon. Au cours de ce processus, une amorce, un court fragment d’ADN conçu pour reconnaître une séquence unique provenant d’une espèce fongique particulière, est ajoutée.

Si l’ADN fongique cible est présent, l’amorce s’y lie et le processus de PCR amplifie cette région, produisant des millions de copies identiques. L’ADN amplifié résultant peut ensuite être détecté et utilisé pour confirmer la présence de l’organisme.

La PCR est l’une des méthodes les plus courantes pour diagnostiquer les infections fongiques. Étant donné que de nombreux échantillons diagnostiques ne contiennent que quelques organismes fongiques, la PCR est capable de détecter des infections fongiques dans des échantillons où la culture fongique n’a pas permis la croissance d’organismes. ^[1]

Cette méthode de test est également rapide, permettant d’obtenir des résultats en quelques jours après la soumission de l’échantillon, comparativement à plusieurs semaines pour la culture fongique et l’identification.

Les infections fongiques couramment diagnostiquées par PCR comprennent : ^[1]

• Aspergillose
• Cryptococcose
• Infections à levures
• Pythiose

Détection des antigènes

La détection des antigènes consiste à introduire dans l’échantillon un anticorps coloré dirigé contre un champignon. Si le champignon est présent, l’anticorps se lie au champignon, ce qui permet aux diagnosticiens d’identifier les anticorps colorés au microscope.

Les tests de détection des antigènes sont disponibles pour : ^[1]

• Aspergillose
• Cryptococcose
• Candidose

Sérologie

Les tests sérologiques permettent de déterminer s’il existe des anticorps contre le champignon dans la circulation sanguine du cheval. La présence d’anticorps indique que le cheval a été exposé au champignon auparavant, ce qui déclenche la production d’anticorps par son système immunitaire.

Bien que ce type de test soit plus courant pour les maladies virales et bactériennes, il peut aider à identifier des infections fongiques telles que la coccidioïdomycose et l’aspergillose. ^[1]

Tests de sensibilité aux antifongiques

Les tests de sensibilité aux antifongiques peuvent être disponibles dans certains laboratoires. La procédure de test de sensibilité consiste à exposer le champignon cultivé à partir d’un échantillon à des concentrations croissantes de médicaments antifongiques. ^[4]

En identifiant quels médicaments sont les plus susceptibles d’inhiber ou de tuer le champignon, le test de sensibilité aide les vétérinaires à choisir le traitement le plus efficace tout en minimisant l’exposition inutile à des médicaments inefficaces.

Les organismes fongiques cultivés à partir de l’échantillon sont soit mis en suspension dans un bouillon nutritif, soit transférés vers un nouveau milieu de culture. Si un bouillon est utilisé, les diagnosticiens ajoutent des concentrations croissantes de médicaments antifongiques et surveillent la croissance fongique.

La concentration à laquelle le champignon cesse de croître est considérée comme la concentration minimale inhibitrice, soit la quantité de médicament nécessaire pour empêcher la croissance fongique. ^[4] Les vétérinaires peuvent utiliser la concentration minimale inhibitrice pour déterminer les doses efficaces de médicament.

Pour les tests de sensibilité utilisant des milieux de culture, les diagnosticiens placent un disque de papier imprégné de médicament antifongique directement sur le milieu de culture.

À mesure que le médicament se diffuse dans le milieu de culture, il élimine les colonies fongiques. Les diagnosticiens mesurent la distance entre le disque et la première colonie fongique qui se développe avec succès afin de déterminer l’efficacité du médicament. ^[4]

Cette méthode ne permet pas d’obtenir une concentration minimale inhibitrice précise, mais peut donner aux vétérinaires une indication des antifongiques les plus efficaces.

Interprétation des résultats

L’interprétation des tests fongiques peut être difficile, car les chevaux sont exposés quotidiennement à de nombreux organismes fongiques. De nombreux organismes fongiques peuvent être présents sur une peau saine, dans les voies respiratoires ou dans le système gastro-intestinal sans provoquer de maladie. ^[1]
Par conséquent, la présence d’éléments fongiques dans un échantillon ne confirme pas toujours une infection active. Ces organismes peuvent produire un faux positif lors des tests, ce qui nécessite une évaluation attentive par le vétérinaire afin de déterminer s’ils causent réellement une infection.

Les vétérinaires doivent évaluer si l’organisme fongique détecté agit comme un véritable agent pathogène ou simplement comme un contaminant incident. Des facteurs tels que la localisation de l’organisme dans les tissus, le degré d’inflammation associée et la cohérence des résultats entre plusieurs modalités diagnostiques (c.-à-d. examen microscopique, culture ou PCR) aident à déterminer la pertinence clinique.

Par exemple, l’identification d’hyphes fongiques envahissant les tissus à l’histopathologie constitue une preuve plus solide d’infection qu’un résultat de culture positif seul.

De plus, un très faible nombre d’organismes fongiques peut provoquer une infection entraînant des signes cliniques chez le cheval atteint. Cela signifie que les chances de recueillir un organisme fongique dans l’échantillon diagnostique sont faibles, ce qui peut mener à un faux négatif.

Cela se produit lorsqu’une infection fongique est présente, mais qu’aucun organisme fongique n’est présent dans l’échantillon soumis à l’analyse.

Dans ces cas, les vétérinaires ayant une forte suspicion d’infection fongique peuvent prescrire des médicaments antifongiques même avec un résultat négatif. ^[1] Ils peuvent également effectuer un nouvel échantillonnage ou modifier les méthodes de prélèvement afin d’augmenter les chances d’obtenir un résultat positif.

Frequently Asked Questions

Here are some frequently asked questions about diagnosing fungal diseases in horses:

Résumé

Les maladies fongiques chez les chevaux peuvent provoquer des affections allant d’infections cutanées à des maladies graves et potentiellement mortelles chez les chevaux.

• Les infections fongiques équines courantes comprennent l’aspergillose, la candidose, la cryptococcose et la dermatophytose (teigne)
• Les signes cliniques sont souvent non spécifiques et peuvent ressembler à des infections bactériennes
• Le diagnostic implique un examen microscopique, une culture fongique et des tests moléculaires tels que la PCR
• Une collecte et une manipulation appropriées des échantillons sont essentielles pour éviter la contamination et les faux négatifs
• Une détection précoce permet un traitement antifongique rapide et améliore le pronostic